Fils du peintre Claude-Marie Dubufe et d'Edmée Duménillet, Édouard Dubufe est d'abord l'élève de son père, puis de Paul Delaroche à l'École des beaux-arts de Paris à partir de 1834.
Il obtient une médaille de 3e classe au Salon de 1839.
Peintre d'histoire et de compositions religieuses, il est également portraitiste.