Né au sein d'une famille modeste, sa mère meurt lorsqu'il a sept ans, laissant son père (boulanger) avec quatre enfants à charge. Pierre-Eugène Rougerie manifeste alors son intention d'être prêtre et fait ses études au petit séminaire du Dorat puis au grand séminaire de Limoges.
Il est ordonné prêtre le 7 octobre 1855, alors qu'il n'a pas 24 ans et fut évêque de Pamiers de 1881 jusqu'à sa mort en 1907.
Passionné de météorologie, il consacra ses loisirs à la recherche des origines des courants atmosphériques marins. Il mit également au point plusieurs appareils d'expérimentation météorologiques.